Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms