Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms