Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms