Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13bQ9WU72 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms