Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms