Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6cQ9WTM3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms