Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms