Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms