Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms