Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Fhl3Q9R059 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Fhl3Q9R059 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Fhl3Q9R059 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fhl3Q9R059 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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