Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms