Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms