Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms