Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms