Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms