Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms