Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms