Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phtf1Q9QZ09 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms