Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms