Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e3Q9QXZ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms