Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms