Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms