Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf3Q9QXK7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms