Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms