Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3a1Q9QX15 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms