Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms