Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms