Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid2Q9QUS6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms