Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms