Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gkap1Q9JMB0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkap1Q9JMB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms