Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prg4Q9JM99 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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