Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms