Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms