Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm1Q9JLF6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms