Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms