Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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