Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms