Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms