Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole3Q9JKP7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms