Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms