Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms