Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Uchl3Q9JKB1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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