Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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