Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms