Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb4Q9JIN6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb4Q9JIN6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb4Q9JIN6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb4Q9JIN6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb4Q9JIN6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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