Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms