Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn19Q9ET38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms