Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms