Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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