Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tlnrd1Q9ERE8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms